Skip to content

pfeiferl/handbook_bioinfoCZ

Repository files navigation

Build Status

Pro vytvoření této knihy byly použity R balíčky R Markdown a bookdown (https://github.com/rstudio/bookdown). Skripta Bioinformatika: Základy vznikla z potřeby moderního výukového materiálu pro studijní obor Bioinformatika. Kapitoly pokrývají nejdůležitější témata, se kterými se student (genomické) bioinformatiky může setkat. V první části je obecně popsána bioinformatika, základy biologie a sekvenační techniky, databáze a nástroje. Následující kapitoly popisují zpracování a kontrolu kvality hrubých sekvenačních dat, alignment, mapování a assembly. Poslední kapitoly popisují následné zpracování získaných dat, včetně funkční analýzy. Skripta jsou zaměřena především pro studenty předmětů Genomika: Algoritmy a analýza a Analýza genové exprese. Užitečné informace v ní však najdou i další zájemci o tento obor.

You can find the example used for creating this book at https://bookdown.org/yihui/bookdown-demo/.